云南太阳能使用二年以上水箱内都会有一层水垢。这是由于水中溶有一定数量的钙镁盐类，如碳酸氢盐、碳酸盐等同时还含有泥沙和有机物等，这些盐类在受热过程中发生物理和化学变化而形成水垢，就像我们用电开水壶烧开水一样久了都会看到有一层水垢。水中含有碳酸氢钙在水温升高过程中会分解生成难溶的碳酸钙。

一、降低热效率

　　由于水垢比金属的导热系数小几百倍。因此，即使在受热面上形成不太厚的水垢，也会因为热阻大，使其导热效率降低，造成热损失。

　　受热面上结有水垢，会使金属管壁局部过热，当壁温超过其工作允许极限温度时，就会使其局部鼓包，这种现象多发生在电加热管上，也是致使电加热管损坏的主要原因之一。

二、降低循环量

　　太阳能热水器真空管内结垢后，流通截面积减少，增加了水循环的速度和流动阻力致使升温效果明显下降。

三、降低使用寿命

　　水垢附在真空管内，很难清除。为了除垢需要经常清洗，因而增加检修次数，费时费料费财。而且可能由于除垢方法不当而降低使用寿命。

四、腐蚀金属内壁

　　水垢是一种复杂的盐类，其中含有卤素离子，在高温下对铁有腐蚀作用。通过对铁质水垢的分析，可知它含铁量达20～30％左右。水垢的侵蚀会使金属内壁变脆并不断向深处腐蚀。

五、使传感器失效

　　水垢的导热系数低，一旦结垢，传感器内部的感温元件不能及时感应到外部水温的变化，使得显示的温度比实际水温要低。

　　因为水垢的特性，使得水位显示出现偏差 。这个过程一般有两种现象：一种是结垢初期水垢稀松似海绵状，这时的水垢能吸收水份，即使水箱内只有少量水也会因为毛吸现象而显示满水位；另一种是结垢后期水垢坚硬、致密，由于水垢阻碍了电信号的传送，水箱内就是注满水也会显示缺水或无水。